Secara keseluruhan perbedaan utama antara anime dan manga adalah sederhana yaitu yang satu animasi dan satu lagi dalam bentuk gambar dan kata-kata di atas kertas. Meskipun ini adalah perbedaan utama, ada juga banyak perbedaan lain yang lebih halus yang akan luput dari perhatian jika seseorang mengatakan, misalnya, hanya menonton anime versi anime dari serial yang juga dalam format manga.
Dalam budaya Barat, Anime diucapkan mengacu pada animasi yang berasal dari Jepang sedangkan di Jepang, Anime mengacu pada animasi secara keseluruhan. Animasi Jepang diproduksi sejak sekitar tahun 1917, namun baru pada tahun 70-an dan 80-an tampilan dan nuansa anime yang kita kenal sekarang ini mulai populer. Selama waktu itu, serial seperti “Gundam” menjadi populer di negara-negara Barat. Ini sangat kontras dengan manga karena manga dalam bentuknya yang paling sederhana adalah buku seni komik Jepang. Manga modern berasal selama Perang Dunia Kedua, dan sangat dipengaruhi oleh buku komik barat dan seni Jepang sebelum perang.
Kebanyakan anime akan berasal dari manga namun ini tidak berarti mereka sama. Alasan untuk ini adalah bahwa tujuan utama anime dan manga adalah untuk menghasilkan keuntungan sehingga biaya produksi keduanya sangat berbeda. Manga akan lebih murah seperti dalam bentuk kertas dan banyak detail dapat masuk ke isinya juga jumlah detail sangat penting karena kebanyakan anime berasal dari manga. Namun beberapa detail perlu dihilangkan pada saat menyangkut anime dan alasannya adalah karena biaya produksi anime jauh lebih tinggi daripada manga sehingga beberapa sub plot utama dari karakter tertentu harus ditinggalkan karena hingga pemotongan anggaran. Perbedaan lainnya adalah terkadang anime akan bergerak terlalu cepat dalam hal pengembangan cerita dan untuk mencegah hal ini terjadi, beberapa anime keluar dari plot dalam apa yang dikenal sebagai filler arc yang tidak memiliki relevansi dengan plot sebenarnya. Ini tidak terjadi di manga. Perbedaan lainnya adalah bahwa anime harus mengikuti slot waktu dan terkadang beberapa adegan harus dipotong dari manga agar bab selesai tepat waktu dengan beberapa hal yang terjadi daripada tidak ada yang terjadi dalam hal pengembangan cerita.
Secara keseluruhan perbedaan antara manga dan anime tidak terlalu banyak karena keduanya menceritakan kisah yang sama jika keduanya adalah seri yang sama.